Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GINS3Q9BRX5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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GINS3Q9BRX5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
GINS3Q9BRX5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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