Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DUSP9Q99956 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms