Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIK3R4Q99570 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms