Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC22A12Q96S37 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC22A12Q96S37 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC22A12Q96S37 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC22A12Q96S37 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC22A12Q96S37 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC22A12Q96S37 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC22A12Q96S37 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms