Protein–RNA interactions for Protein: Q96M95

CCDC42, Coiled-coil domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42Q96M95 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC42Q96M95 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC42Q96M95 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC42Q96M95 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC42Q96M95 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC42Q96M95 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC42Q96M95 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC42Q96M95 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC42Q96M95 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC42Q96M95 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC42Q96M95 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC42Q96M95 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC42Q96M95 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC42Q96M95 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC42Q96M95 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC42Q96M95 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC42Q96M95 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC42Q96M95 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC42Q96M95 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC42Q96M95 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC42Q96M95 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC42Q96M95 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC42Q96M95 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC42Q96M95 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms