Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CELF6Q96J87 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CELF6Q96J87 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms