Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MTERF3Q96E29 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms