Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYTL4Q96C24 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms