Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LRRN4Q8WUT4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRN4Q8WUT4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRN4Q8WUT4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRN4Q8WUT4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRN4Q8WUT4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRRN4Q8WUT4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms