Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHBDD1Q8TEB9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms