Protein–RNA interactions for Protein: Q8N668

COMMD1, COMM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD1Q8N668 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
COMMD1Q8N668 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms