Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD35Q8N283 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms