Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms