Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BHLHA9Q7RTU4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms