Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SSH2Q76I76 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms