Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PDZRN4Q6ZMN7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PDZRN4Q6ZMN7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms