Protein–RNA interactions for Protein: Q6XXX2

LINC00114, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00114, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00114Q6XXX2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LINC00114Q6XXX2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms