Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAF7Q6Q0C0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAF7Q6Q0C0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms