Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC158Q5M9N0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms