Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COLEC12Q5KU26 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COLEC12Q5KU26 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms