Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDCA8Q53HL2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDCA8Q53HL2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms