Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC38Q502W7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms