Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTXN3Q4LDR2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms