Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPRNQ4KMQ1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms