Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LETM2Q2VYF4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LETM2Q2VYF4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms