Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms