Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SPHKAPQ2M3C7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPHKAPQ2M3C7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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