Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Q1T7F1 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Q1T7F1 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Q1T7F1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Q1T7F1 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Q1T7F1 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Q1T7F1 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Q1T7F1 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Q1T7F1 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Q1T7F1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Q1T7F1 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Q1T7F1 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Q1T7F1 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms