Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPROQ16827 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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