Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SGCAQ16586 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SGCAQ16586 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SGCAQ16586 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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SGCAQ16586 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SGCAQ16586 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms