Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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SCN9AQ15858 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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SCN9AQ15858 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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SCN9AQ15858 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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SCN9AQ15858 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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SCN9AQ15858 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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SCN9AQ15858 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
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SCN9AQ15858 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCN9AQ15858 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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