Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEBPEQ15744 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEBPEQ15744 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms