Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALX1Q15699 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALX1Q15699 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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