Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIP13Q15645 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIP13Q15645 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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