Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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SEC23BQ15437 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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SEC23BQ15437 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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SEC23BQ15437 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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SEC23BQ15437 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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SEC23BQ15437 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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SEC23BQ15437 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SEC23BQ15437 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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