Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYCP1Q15431 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
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