Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PDK1Q15118 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PDK1Q15118 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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