Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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BRD3Q15059 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BRD3Q15059 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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BRD3Q15059 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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BRD3Q15059 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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BRD3Q15059 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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BRD3Q15059 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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BRD3Q15059 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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BRD3Q15059 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BRD3Q15059 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
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