Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NCAPHQ15003 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NCAPHQ15003 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms