Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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GPNMBQ14956 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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GPNMBQ14956 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GPNMBQ14956 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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GPNMBQ14956 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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GPNMBQ14956 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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GPNMBQ14956 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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GPNMBQ14956 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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GPNMBQ14956 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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GPNMBQ14956 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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GPNMBQ14956 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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GPNMBQ14956 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPNMBQ14956 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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