Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NFIXQ14938 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NFIXQ14938 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
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