Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IKBKEQ14164 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms