Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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EFR3AQ14156 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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EFR3AQ14156 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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EFR3AQ14156 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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EFR3AQ14156 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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EFR3AQ14156 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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EFR3AQ14156 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EFR3AQ14156 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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