Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DDX39BQ13838 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms