Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TUBA3CQ13748 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TUBA3CQ13748 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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