Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ALCAMQ13740 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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