Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IKZF1Q13422 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IKZF1Q13422 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms