Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ITGB3BPQ13352 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms