Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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TRIM32Q13049 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM32Q13049 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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