Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CDC16Q13042 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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